無土栽培農(nóng)作物的營養(yǎng)來源可以利用家畜禽類的糞便、沼氣肥料、生物有機(jī)肥料（生物有機(jī)殘?bào)w或活性微生物菌肥料）。
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1、在基質(zhì)栽培中的使用，首先必須通過高溫發(fā)酵，以免將病源微生物及蟲卵、草籽帶入栽培系統(tǒng)。其次必須經(jīng)烘干并粉碎至顆粒小于3毫米，作基肥時(shí)可以直接與基質(zhì)混合均勻，以肥源的有效成份含量多少來確定混合量，一般每立方米基質(zhì)中可混入純雞糞10～15千克，或餅肥15～20千克，或其他種類有機(jī)肥20～50千克不等。
2、做追肥時(shí)可以有兩種用法：采用表面撒施的方法，施用后直接滴灌清水，這種方法的缺點(diǎn)是必需人工施肥，而且只能表面追施，易出現(xiàn)基質(zhì)表面濃度高，中、下部濃度低的現(xiàn)象，不利于根系對養(yǎng)分的平衡吸收；追施法就是將有機(jī)肥加入水中浸泡24h以上，用80目以上的網(wǎng)紗過濾，取肥液加入營養(yǎng)液池中，通過水泵及滴灌系統(tǒng)均勻供液。
3、肥液兌水稀釋至電導(dǎo)濃度1.8～2.5ms/cm，PH值調(diào)至5.5～6.5之間，這種供給方法的效果比較穩(wěn)定，也比較均勻，不會有燒根現(xiàn)象。單一采用有機(jī)肥時(shí)還必須根據(jù)不同有機(jī)肥的主要大量元素含量，來確定添加無機(jī)肥的種類和用量，以確保作物對各種養(yǎng)分的全面均衡吸收。
4、雞糞中含鈣、磷較多，含氮此之，含鉀最少，所以長期用雞糞追肥時(shí)必須配合鉀肥和氮肥的使用，可以在10千克雞糞中混入1.5～2.0千克的硫酸鉀或硝酸鉀進(jìn)行追施。